導(dǎo)讀
本文分入門篇和進(jìn)階篇。本期是入門篇,主要闡述MPN的歷史和意義,幫你理解MPN。主要是意會(huì)。進(jìn)階篇會(huì)告知MPN的數(shù)學(xué)原理,就是MPN值是怎么算出來(lái)的。進(jìn)階篇閱讀有難度,需具備一定的數(shù)學(xué)基礎(chǔ)。
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引子
剛?cè)肼毜男∶鞒闪艘幻鈽s的微生物試驗(yàn)員,在工作幾天后,他懷著崇敬而期待的心情問(wèn)了師父一個(gè)問(wèn)題:“啥是MPN?”
師父平靜的回答:“最大可能數(shù)”
小明想了想,怯怯的又問(wèn):“那啥是最大可能數(shù)?”
師父故作高深的回答:“是一種用統(tǒng)計(jì)學(xué)算出來(lái)的樣品中最可能的數(shù)!”
小明又想了想,又問(wèn):“這個(gè)數(shù)有什么意義?它是怎么算的?”
師父悠悠的回了一句:“今天的培養(yǎng)皿都洗了么?三角瓶呢?鹽水滅了沒(méi)?”
小明聽聞,驚恐而遁。
師父凝望小明背影,回身遙望窗外,心想:“20年了,我干這行20年了,當(dāng)年我也是這么問(wèn)的師父,但是沒(méi)有答案,誰(shuí)能告訴我啊,啥是MPN~~~~~~~~~~~~”
入門篇
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要想說(shuō)清楚MPN,就首先要了解發(fā)酵管計(jì)數(shù)法(稀釋計(jì)數(shù)法)。
有些樣品是不適合用平板法計(jì)數(shù)的,比如菌含量很低的,或者有雜質(zhì)干擾的樣品。菌含量很低的樣品中最典型的是水。所以發(fā)酵管計(jì)數(shù)法主要用于水質(zhì)中大腸類細(xì)菌的檢測(cè)。有資料顯示這種方法最早出現(xiàn)在1875年前后,巴斯德用此種方法做過(guò)菌數(shù)檢測(cè),之后李斯特等人也用過(guò)這種方法,20世紀(jì)初已經(jīng)廣泛應(yīng)用于水質(zhì)檢測(cè)。
那么發(fā)酵管法是怎么計(jì)數(shù)的呢?其實(shí)很簡(jiǎn)單,比如一個(gè)水樣,將其稀釋10倍、100倍和1000倍,每個(gè)稀釋度分別取1mL稀釋液接種1管發(fā)酵管(比如乳糖膽鹽肉湯)。如果10倍和100倍生長(zhǎng),1000倍不生長(zhǎng),那么可以粗略的認(rèn)為1mL水樣中的菌含量在100-1000個(gè)之間。
后來(lái)又有進(jìn)步。比如還按上面的例子,稀釋倍數(shù)不變,每個(gè)稀釋度接種管數(shù)從1管變成5管,培養(yǎng)后10倍5管全長(zhǎng),100倍5管有4管生長(zhǎng),1000倍都不長(zhǎng)。那么計(jì)算方式改為。結(jié)果就變成了1mL水樣中的菌含量是80個(gè)。
是不是先進(jìn)了很多?但是以你今天的眼光看,這簡(jiǎn)直弱爆了,對(duì)么?
但是你考慮過(guò)么?當(dāng)時(shí)的中國(guó)還處于清朝。
頓時(shí),你是不是又覺(jué)得,這簡(jiǎn)直太先進(jìn)了~~~~
這種發(fā)酵管計(jì)數(shù)的結(jié)果不準(zhǔn),你看到了。還有一個(gè)人也看到了,他就是M. H. McCrady,就職于加拿大魁北克省衛(wèi)生委員會(huì)實(shí)驗(yàn)室。1915年一篇雄文問(wèn)世,MPN的名號(hào)從此響徹江湖。
《The Numerical Interpretation of Fermentation-Tube Results》(譯:發(fā)酵管結(jié)果的數(shù)值解釋),發(fā)表于美國(guó)《傳染病雜志》。他用概率論方法分析了發(fā)酵管計(jì)數(shù)的結(jié)果,從而第一次提出了MPN(Most Probable Number)的叫法,并算出了最早的MPN表。
之后,專業(yè)的數(shù)學(xué)家紛紛登場(chǎng),開始將此方法進(jìn)行完善。Halvorson和Ziegler(1933),Eisenhart和Wilson(1943)和Cochran(1950)發(fā)表了有關(guān)MPN法統(tǒng)計(jì)學(xué)基礎(chǔ)的文章。 Woodward(1957)建議MPN表應(yīng)省略那些不可能的陽(yáng)性組合(如:0-0-3)。 De Man(1983)發(fā)布了置信區(qū)間方法。
至此,MPN法才變成了今天我們看到的樣子。
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好了,背景介紹完了,現(xiàn)在開始幫助大家理解MPN的意義。這里會(huì)提到一些統(tǒng)計(jì)學(xué)的概念,但沒(méi)有計(jì)算,計(jì)算留在進(jìn)階篇。沒(méi)辦法,MPN畢竟是統(tǒng)計(jì)學(xué)基礎(chǔ)上算出來(lái)的,想一點(diǎn)統(tǒng)計(jì)學(xué)概念不提就解釋清楚太難了。
我們以大腸菌群MPN法為例。我們把1mL樣品接入一管LST,培養(yǎng)后結(jié)果只會(huì)有兩種可能,產(chǎn)氣或不產(chǎn)氣。從根源上說(shuō)就是陽(yáng)性或陰性。那么這種只有兩種結(jié)果的試驗(yàn),在統(tǒng)計(jì)學(xué)上叫伯努利試驗(yàn)。生活中還有很多例子,比如電源只有開和關(guān),比如拋硬幣,只有正面和反面。沒(méi)有中間的立場(chǎng),沒(méi)有妥協(xié)的余地。
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我們MPN法試驗(yàn)一般都是9管,3個(gè)稀釋度,每個(gè)稀釋度3管。那么相當(dāng)于把伯努利試驗(yàn)分了3組,每組做了3次。每組內(nèi)的3管之間的結(jié)果沒(méi)有相互干擾,是相互獨(dú)立的,發(fā)生的概率也是一樣的。這種每組內(nèi)的3次試驗(yàn)就叫n重伯努利試驗(yàn)。比如拋硬幣,你連續(xù)拋20次,每次只有兩種可能,正面和反面,而且第一次拋出的結(jié)果,對(duì)第二次拋出正面還是反面沒(méi)有任何影響。
至此,基本概念已經(jīng)建立起來(lái),為了幫助理解,我們拋開微生物,開始玩拋硬幣游戲。
準(zhǔn)備一個(gè)硬幣,連續(xù)拋20次,請(qǐng)問(wèn)正面能有幾次?
理論上,0-20次,皆有可能。有人運(yùn)氣無(wú)敵,連續(xù)20次正面。有人運(yùn)氣也無(wú)敵,一個(gè)正面都沒(méi)有。到底最可能幾次正面呢?伯努利概型是有公式的,所以來(lái)看計(jì)算結(jié)果吧。
表格不好看? 那我們換成圖。
從這個(gè)圖看,是不是一目了然。這就是二項(xiàng)式分布,也叫伯努利分布。在0-20次正面的所有可能中,得到10次正面的概率最高。那么10次就是拋20次硬幣后,最可能得到的正面次數(shù)。也可以說(shuō),是這個(gè)命題下的最大可能數(shù)。
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明白了么?MPN值就是在現(xiàn)有因素下能推算出的微生物含量概率最大的那個(gè)濃度。
MPN法不像平板法,平板法能直觀的去數(shù)平板上的菌數(shù),所以平板法得到的結(jié)果是真實(shí)的,是你試驗(yàn)出來(lái)的,數(shù)出來(lái)的。而MPN法的結(jié)果是通過(guò)幾根試管的陰陽(yáng)性,通過(guò)統(tǒng)計(jì)學(xué)推算出的樣品中的最可能的濃度。由于這個(gè)結(jié)果是推算的,為了與平板法的真實(shí)結(jié)果相區(qū)分,所以有了新的單位MPN。
比如試管陽(yáng)性2-1-0,通過(guò)MPN表查的結(jié)果是15,置信區(qū)間3.7-42?,F(xiàn)在單位是15MPN/g,如果改成15個(gè)菌/g,你是不是就更好理解了?
這里面的3.7-42,就類似上述拋硬幣游戲正面次數(shù)的范圍0-20,只是范圍更小,因?yàn)槭?5%置信區(qū)間。15就相當(dāng)于拋硬幣最可能的那個(gè)10。
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還不明白?那請(qǐng)從入門篇再讀一邊。再讀還不明白?那就默默點(diǎn)左上角的叉叉?。?!
拋硬幣出現(xiàn)10次正面的概率并沒(méi)有想象中的那么高,只有17.6%,但是這已經(jīng)是最可能出現(xiàn)的數(shù)了。你會(huì)不會(huì)覺(jué)得MPN法的結(jié)果不準(zhǔn)?不用擔(dān)心。McCrady先生當(dāng)年都做過(guò)試驗(yàn)驗(yàn)證過(guò),準(zhǔn)的。
試驗(yàn)是這么做的。做大腸檢測(cè),用同一份樣液,做了76組,每組10管。每組的10mL接種液是一次取出,再分別加入10支試管。一共做了760支,最終陽(yáng)性管數(shù)597支,然后又用陽(yáng)性率計(jì)算出了10支試管中陽(yáng)性管數(shù)的分布,發(fā)現(xiàn)和實(shí)際試驗(yàn)情況基本一致。具體看下表。
左側(cè)起,第一列是10管中陽(yáng)性的管數(shù),比如4/10,就是一組10支有4支陽(yáng)性。第二列是當(dāng)時(shí)做試驗(yàn)的情況,第三列是通過(guò)概率計(jì)算出的情況。
例如,我們以7/10為例,就是10支試管有7支陽(yáng)性的,試驗(yàn)中76組試驗(yàn),每組7支陽(yáng)性的組數(shù)是15組,而概率計(jì)算得出的組數(shù)是17組,所以偏差不是很大,整體試驗(yàn)情況和理論計(jì)算情況基本一致。說(shuō)明統(tǒng)計(jì)學(xué)計(jì)算在微生物領(lǐng)域是適用的,MPN法的準(zhǔn)確性是靠譜的。
拋硬幣的概率是明確的,正面的概率就是0.5,所以很好計(jì)算,圖形也很對(duì)稱。但微生物的實(shí)際情況是我們不知道陰陽(yáng)性的概率。那么在下期的進(jìn)階篇,我們就會(huì)看到如何假設(shè)一個(gè)概率,又如何通過(guò)這個(gè)假設(shè)的概率算出樣品中微生物的濃度。
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參考文獻(xiàn):
1.? McCrady, M. H. 1915. The numerical interpretation of fermentation-tube results. J. Infect. Dis. 17:183-212.
2.? U.S. Food & Drug Administration. BAM Appendix 2: Most Probable Number from Serial Dilutions.
3.? 王明慈, 沈恒范. 概率論與數(shù)理統(tǒng)計(jì). 高等教育出版社. 1999年.
未完待續(xù)